用于生物反應器之微生物是由大阪府立公眾衛生研究所的杉浦涉主任研究員發現的bacillus屬菌種菌體，bacillus菌會分解偶氮染料，將此微生物所產生的偶氮染料進行分解的酵素足在菌體內所制造。
反應是將屬於發色團的偶氮基進行分解還原，變換成胺化合物。在反應時，補酵素nadh需要nadph，但因bacillus菌存在於體內，所以不需要固定在生物反應器中。此種bacillus菌成長的范圍相當廣泛，無論是喜氧性或是厭氧性都可見蹤跡。此種微生物的特點是生成顏色的分解酵素之營養源含有機成分，在無氧狀態之壓氧性環境中會產生活絡的代謝反應，在菌體外生成脫色酵素。將此微生物固定在流動床用多孔質載體上，進行連續脫色實驗。
使用的流動床用載體是將含有碳的聚乙烯的連續氣泡發泡體切成1公分方塊，當一投入喜氧的生物反應器槽內時，4－5天就會開始流動。流動床用載體中的bacillus菌的菌數的108個／me以上，經常超過溶液中的bacillus菌的菌數，由此可知bacillus菌好好地載附在載體上。
著色度是利用稀釋法，使用30cm透視度計，以蒸餾水持續不斷地稀釋廢排水，然后和加入透視度計之蒸餾水進行著色之比較，并將看不到著色的稀釋倍率當做測定值。
原水的著色度之差類很大，高達280－900。原水之著色度的變化因采集時間有很大的變化，當原水槽的水位下降時，要能夠自動補充。因此，未進行平均的染色廢排水之采集，原水的分析值和實際處理的原水含有落差之可能性。為此，要研討平均原水的采集方法。
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